Si ya tienes los datos, partimos de ellos. Analizamos datos crudos de secuenciación, tablas de expresión o resultados de otras plataformas, reutilizamos datos públicos para validar o ampliar tus hallazgos y combinamos varias capas ómicas para responder a tu pregunta.
Da igual en qué punto del proceso estén: retomamos el análisis desde el formato que tengas.
Lecturas de secuenciación o archivos de instrumento recién salidos de la plataforma. Hacemos el control de calidad y todo el procesamiento.
Matrices de conteos, tablas de abundancia o resultados de otro proveedor que necesitan un análisis más profundo o una segunda opinión.
Estudios ya publicados en repositorios internacionales que se pueden reanalizar con tu pregunta en mente.
Trabajamos con datos de todas las capas ómicas, de tejido completo o de células individuales.
mRNA-seq, Total RNA-seq, lncRNA, circRNA, small RNA e Iso-Seq.
scRNA-seq, snRNA-seq, TCR/BCR y datos espaciales.
WGS y WES, variantes, CNV y ensamblaje de genomas.
Metilación de DNA, ChIP-seq y RIP-seq.
Amplicones 16S/18S/ITS, shotgun y metatranscriptómica.
Olink (NPX) y datos de espectrometría de masas.
LC-MS no dirigida: detección, anotación y estadística.
Variables clínicas y fenotípicas para integrar con las ómicas.
Hay miles de estudios ómicos publicados con datos accesibles. Bien reanalizados, aportan mucho valor, sobre todo cuando las muestras propias son pocas.
Cada ómica cuenta una parte de la historia. Integrarlas permite ver cómo un cambio en el genoma o en la expresión se traduce en proteínas y metabolitos.
Revisión de los datos de partida antes de analizarlos, para saber qué se puede responder con ellos.
Expresión diferencial, rutas, redes o integración, según tu pregunta.
Gráficos listos para artículo, memoria o comité.
Qué significan los resultados y cuáles son los siguientes pasos.
Acceso a nuestro software para explorar los resultados sin programar: buscar cualquier gen o proteína, comparar grupos y generar gráficas interactivas.
Cuéntanos qué datos tienes y qué quieres responder. Te decimos qué se puede obtener de ellos y te enviamos una propuesta.